约克螺杆机进水后，是否需要更换轴承取决于轴承的受损情况。

首先，需要对主轴承进行检查和测量。如果拆下端座后，使用内径量表测量内径发现磨损量不大，那么可能不需要更换轴承。然而，如果主轴承有严重磨损或损坏，特别是配合间隙过大导致转子下部与缸体产生摩擦时，就必须更换新的轴承。

另外，进水还可能导致轴封磨损或其他相关问题，这些问题也需要一并检查和解决。

总的来说，是否更换轴承应根据具体的检查结果和受损情况来确定。建议在这种情况下联系维修公司，他们可以通过详细的检查和评估，确定是否需要更换轴承，并进行相应的维修工作。